在电商的发展过程中，与物流企业的良性合作起到了关键作用，电商平台在达成网购订单后，由物流企业负责将货物运送到消费者手中。电商和物流的长期合作的影响无疑是正面的，电商行业近十年来的高速发展很好的佐证了这一点。但当电商业务发展到今天的规模，电商和物流之间的良性合作却出现裂痕。国际电商巨头亚马逊以及国内电商巨头阿里等，都表现出自建物流体系的意图，这对于物流行业来说自然不是个好消息。
国内影响力最大的电商平台阿里巴巴建设的菜鸟物流，整合了国内多家物流企业的资源，实现了消费者的快递包裹更优质高效的配送。但从另一方面来看，有电商企业负责统筹物流业务，这对于电商物流的合作关系也将产生影响，物流企业在面对电商平台将拥有更少的话语权。相比较而言，美国电商巨头亚马逊涉足物流业务更加直接，而此举甚至引发亚马逊此前合作物流企业股价的大跌，之前的合作关系之后很可能就变成了竞争关系。
对于电商平台来说，自建物流能够提高业务展开的灵活性，还能有效降低来自物流的运营成本。而对于物流企业来说，要想尽可能降低对自身业务的负面影响：一方面需要对物流业务中间环节进行优化，提高物流配送的效率同时有效降低运送成本;另一方面需要降低对电商业务的依赖，更多的发掘市场中潜在的来自非电商领域的订单。